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CGI-Clinics: un proyecto de cinco años para mejorar los tratamientos personalizados del cáncer

16 diciembre 2022

Del 21 al 23 de noviembre de 2022 se celebró la reunión inaugural de CGI-Clinics, un proyecto de cinco años financiado por la Unión Europea y UK Research and Innovation, que comenzó el 1 de noviembre. 60 participantes de las 17 instituciones miembros del consorcio se reunieron en Empúries (Girona, España).

El proyecto pretende construir una nueva herramienta, llamada Cancer Genome Interpreter (CGI), una herramienta bioinformática lo suficientemente potente como para lograr el objetivo de sistematizar la interpretación del genoma tumoral para la toma de decisiones clínicas, permitiendo así a los médicos elegir los tratamientos contra el cáncer más eficaces para cada paciente.

La herramienta utiliza el aprendizaje automático y otros métodos computacionales para extraer sistemáticamente información de las mutaciones observadas en miles de tumores con el fin de mejorar la interpretación de las variantes observadas en cada paciente.

En el proyecto participan el Instituto de Investigación Biomédica de Girona Dr. Josep Trueta (IDIBGI) y el ICO Girona, siendo los investigadores principales el Dr. Ramon Brugada, jefe del grupo de Genética Cardiovascular y jefe de Cardiología de los hospitales Trueta y Santa Caterina, y los doctores Joan Brunet y Joaquim Bosch, investigadores del grupo de investigación de Oncología de Precisión del IDIBGI y a su vez oncólogos del ICO Girona.

"El Cancer Genome Interpreter, en el que llevamos trabajando más de cinco años, tiene un inmenso potencial y, a través de este proyecto, pretendemos optimizarlo para su uso en hospitales y centros sanitarios. Queremos que sea un instrumento clave de apoyo a la toma de decisiones de los oncólogos clínicos, para que cada paciente, independientemente del hospital en el que se realice el diagnóstico, reciba el tratamiento más adecuado", explica la Dra. Nuria López-Bigas (IRB Barcelona), coordinadora del consorcio.

El proyecto también incluye la creación de "juntas moleculares virtuales de tumores" en las que participan expertos internacionales con los que los médicos pueden consultar y discutir el informe elaborado por el Intérprete del Genoma del Cáncer. El objetivo de estas reuniones es promover el intercambio de conocimientos y ofrecer así una gestión óptima del tratamiento a todos los pacientes, en particular a los que son tratados en centros sanitarios más pequeños y que a menudo no tienen acceso a muchos oncólogos especializados.

Los participantes en el Kick-off Meeting pasaron tres días disfrutando de excelentes presentaciones y charlas científicas, y compartiendo metodologías y acciones para los próximos cinco años. Hubo varios talleres y sesiones de trabajo para iniciar el desarrollo de la nueva herramienta e intercambiar ideas sobre los distintos aspectos del proyecto.

Un proyecto impulsado por la comunidad

El consorcio del proyecto está formado por 17 organizaciones europeas diferentes que ofrecen experiencia complementaria para abordar la implementación de la medicina personalizada del cáncer desde todos los ángulos.

El IRB Barcelona, coordinador del proyecto, lidera el desarrollo de la herramienta. Nueve hospitales y centros de salud de cuatro países europeos son socios del proyecto y serán los primeros en introducir la plataforma en sus sistemas: el Instituto de Oncología Vall d'Hebron (España); el Gustave Roussy (Francia); el Leon Berard Centre de Lutte Contre le Cancer (Francia); Uniklinik RWTH AACHEN (Alemania); Universitätsklinikum Köln AöR (Alemania); el Manchester Cancer Research Centre (Reino Unido); el Instituto de Investigación Biomédica de Girona Dr. Josep Trueta – IDIBGI (España); la Fundació Althaia - Hospital Sant Joan de Déu de Manresa y el Servicio Andaluz de Salud (España), así como el Instituto Catalán de Oncología (España) y la Fundación Progreso y Salud de la Junta de Andalucía (España).

Otro centro de investigación, el Centro Nacional de Análisis Genómico (España) pondrá en marcha la estrategia de intercambio de datos. La empresa Alira Health es el socio encargado de velar por los aspectos regulatorios y la Asociación Europea para la Investigación del Cáncer gestionará las acciones de comunicación asociadas al proyecto.

Un pilar fundamental de este proyecto es la participación de las personas con cáncer. Los socios del proyecto, la Coalición Europea de Pacientes con Cáncer y la Asociación Española Contra el Cáncer, representarán a la sociedad y a los pacientes.

Participación de pacientes

El proyecto pretende implicar a los pacientes con cáncer para que puedan desempeñar un papel activo en el proceso de personalización de su propio tratamiento oncológico. Para ello, la herramienta final de interpretación del genoma creada por el proyecto también proporcionará a los pacientes un informe que podrán comentar con su médico, informándoles sobre las características moleculares de su tumor y lo que esto significa para su tratamiento.

El proyecto también pretende destacar el valor de la información y concienciar a los pacientes de que pueden ayudar a mejorar el sistema aceptando compartir los detalles moleculares de sus tumores y su información clínica. En su versión actual, los algoritmos del Intérprete del Genoma del Cáncer se han desarrollado a partir del análisis de los genomas de los tumores de 28.000 pacientes, que abarcan más de 66 tipos de cáncer, y que están a disposición de la comunidad científica en repositorios públicos. A medida que se añadan nuevos tumores secuenciados en el transcurso del proyecto, los métodos de aprendizaje automático mejorarán sus predicciones, mejorando así la interpretación de las mutaciones tumorales para los nuevos pacientes.

Los avances del proyecto

El Kick-off Meeting marcó la pauta de este emocionante y ambicioso proyecto, y todos los socios están muy motivados para cumplir el objetivo principal de llevar a cabo una iniciativa basada en la comunidad para fomentar la implantación de la medicina oncológica de precisión en los hospitales, en beneficio de los pacientes con cáncer. Para estar al día de los avances de CGI-Clinics en los próximos cinco años, siga el proyecto en las redes sociales: Twitter, Facebook, LinkedIn e Instagram e inscríbase en nuestra lista de correo.

El proyecto CGI-Clinics está financiado por la Unión Europea. No obstante, los puntos de vista y opiniones expresados son exclusivamente los del autor o autores y no reflejan necesariamente los de la Unión Europea o la Agencia Ejecutiva Digital y de Salud Europea (HADEA). Ni la Unión Europea ni la autoridad que concede la subvención pueden ser consideradas responsables de las mismas.

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