Los objetivos del Instituto son los siguientes:
- Potenciar la investigación traslacional para mejorar la transferencia del conocimiento científico en relación a la prevención y tratamiento de los problemas de salud más prevalentes.
- Integrar los diferentes tipos de investigación y disminuir el intervalo entre la producción de conocimiento y la aplicabilidad en la práctica médica habitual.
- Potenciar las redes científicas de excelencia.
- Velar por una eficiente utilización de los recursos entre los grupos del Instituto.
- Promover la utilización conjunta de recursos con grupos de execelencia de otras instituciones.
- Potenciar la colaboración con instituciones públicas y privadas cuyos objetivos I+D+I se engloben en el campo de la biomedicina y ciencias de la salud.
- Garantizar un correcto y eficiente uso de los recursos públicos y privados y una correcta práctica investigadora.
- Planificar los objetivos según las posibilidades del Instituto.
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